AdmArwiki

User Tools

Site Tools

You are here: hovedside » admb_real » all_cohorts » preliminary_experiments
Trace:
admb_real:all_cohorts:preliminary_experiments

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Next revision		Previous revision
admb_real:all_cohorts:preliminary_experiments [2010/11/16 13:50] – created lennartfradmb_real:all_cohorts:preliminary_experiments [2010/12/10 14:17] (current) – lennartfr
Line 49: Line 49:
  
 As one can see, the curves follow the VPA estimates relatively closely, with the added bonus of 95% confidence intervals. As one can see, the curves follow the VPA estimates relatively closely, with the added bonus of 95% confidence intervals.
 +
 +Additional output files:
 +
 +<file txt cod.std>
 + index   name        value      std dev   
 +     1   N_firstcol  5.7680e-01 1.2847e-01
 +     2   N_firstcol  3.3147e-01 6.5800e-02
 +     3   N_firstcol  2.6470e-01 4.9345e-02
 +     4   N_firstcol  5.0882e-01 9.7472e-02
 +     5   N_firstcol  6.0897e-01 1.3346e-01
 +     6   N_firstcol  4.0682e-01 9.9672e-02
 +     7   N_firstcol  5.6034e-01 1.5143e-01
 +     8   N_firstcol  3.2939e-01 1.1510e-01
 +     9   N_firstrow  6.4811e-01 1.0516e-01
 +    10   N_firstrow  4.1597e-01 4.5215e-02
 +    11   N_firstrow  1.3496e-01 9.5606e-03
 +    12   N_firstrow  4.9804e-02 2.3641e-03
 +    13   N_firstrow  1.7001e-02 9.4253e-04
 +    14   N_firstrow  1.3497e-02 1.7978e-03
 +    15   N_firstrow  1.0894e-02 1.8848e-03
 +    16   N_firstrow  3.6266e-02 8.7802e-03
 +    17   N_firstrow  1.0000e-02 1.2991e-07
 +    18   q           4.1956e-01 4.2876e-02
 +    19   logs       -1.0961e+00 7.9556e-02
 +    20   M           2.6468e-01 7.0564e-02
 +    21   N           5.7680e+02 1.2847e+02
 +    22   N           6.4811e+02 1.0516e+02
 +    23   N           4.1597e+02 4.5215e+01
 +    24   N           1.3496e+02 9.5606e+00
 +    25   N           4.9804e+01 2.3641e+00
 +    26   N           1.7001e+01 9.4253e-01
 +    27   N           1.3497e+01 1.7978e+00
 +    28   N           1.0894e+01 1.8848e+00
 +    29   N           3.6266e+01 8.7802e+00
 +    30   N           1.0000e+01 1.0607e-04
 +    31   N           3.3147e+02 6.5800e+01
 +    32   N           4.3766e+02 6.7737e+01
 +    33   N           4.5178e+02 4.8836e+01
 +    34   N           2.4053e+02 1.7731e+01
 +    35   N           5.7707e+01 3.2758e+00
 +    36   N           1.3277e+01 8.9379e-01
 +    37   N           5.3581e+00 3.6515e-01
 +    38   N           5.6282e+00 1.0838e+00
 +    39   N           5.5434e+00 1.2267e+00
 +    40   N           2.2055e+01 6.1780e+00
 +    41   N           2.6470e+02 4.9345e+01
 +    42   N           2.5064e+02 3.2854e+01
 +    43   N           3.0320e+02 3.0630e+01
 +    44   N           2.5821e+02 1.9271e+01
 +    45   N           1.0902e+02 5.9225e+00
 +    46   N           1.9701e+01 1.1417e+00
 +    47   N           4.5608e+00 3.8507e-01
 +    48   N           1.7990e+00 1.7612e-01
 +    49   N           2.9955e+00 7.0934e-01
 +    50   N           3.3533e+00 8.6059e-01
 +    51   N           5.0882e+02 9.7472e+01
 +    52   N           1.9727e+02 2.4140e+01
 +    53   N           1.7027e+02 1.3283e+01
 +    54   N           1.7075e+02 1.1536e+01
 +    55   N           1.2103e+02 6.2763e+00
 +    56   N           4.1769e+01 1.6163e+00
 +    57   N           7.0268e+00 4.1142e-01
 +    58   N           1.9476e+00 1.8589e-01
 +    59   N           6.6689e-01 1.0747e-01
 +    60   N           1.9443e+00 4.9340e-01
 +    61   N           6.0897e+02 1.3346e+02
 +    62   N           3.8065e+02 5.0292e+01
 +    63   N           1.2339e+02 1.0167e+01
 +    64   N           7.7231e+01 4.8966e+00
 +    65   N           6.7328e+01 4.2341e+00
 +    66   N           4.2407e+01 1.8814e+00
 +    67   N           1.0266e+01 5.4591e-01
 +    68   N           1.8233e+00 2.1457e-01
 +    69   N           6.1138e-01 1.1853e-01
 +    70   N           2.2555e-01 7.6723e-02
 +    71   N           4.0682e+02 9.9672e+01
 +    72   N           4.4288e+02 7.9336e+01
 +    73   N           2.2392e+02 2.6089e+01
 +    74   N           5.7110e+01 4.3414e+00
 +    75   N           2.8195e+01 2.0010e+00
 +    76   N           2.5184e+01 1.6863e+00
 +    77   N           1.2320e+01 6.7331e-01
 +    78   N           2.8266e+00 2.5306e-01
 +    79   N           6.5870e-01 1.3781e-01
 +    80   N           3.1802e-01 8.3697e-02
 +    81   N           5.6034e+02 1.5143e+02
 +    82   N           3.0646e+02 6.5070e+01
 +    83   N           2.8025e+02 5.0347e+01
 +    84   N           1.0062e+02 1.6075e+01
 +    85   N           1.9931e+01 2.4839e+00
 +    86   N           9.5291e+00 1.1012e+00
 +    87   N           7.1627e+00 9.6720e-01
 +    88   N           2.6801e+00 3.9571e-01
 +    89   N           7.5949e-01 1.6064e-01
 +    90   N           3.5587e-01 9.6655e-02
 +    91   N           3.2939e+02 1.1510e+02
 +    92   N           4.2643e+02 1.0619e+02
 +    93   N           2.0979e+02 4.5924e+01
 +    94   N           1.4367e+02 3.5894e+01
 +    95   N           4.0989e+01 1.1479e+01
 +    96   N           5.5719e+00 1.7762e+00
 +    97   N           2.1888e+00 7.8471e-01
 +    98   N           1.8233e+00 6.8775e-01
 +    99   N           7.9283e-01 2.8001e-01
 +   100   N           3.3652e-01 1.1264e-01
 +   101   N46         1.1990e+03 1.5992e+02
 +   102   N46         1.1300e+03 1.3425e+02
 +   103   N46         8.1204e+02 8.2613e+01
 +   104   N46         5.3828e+02 4.8486e+01
 +   105   N46         5.8127e+02 6.3160e+01
 +   106   N46         7.2392e+02 9.7449e+01
 +   107   N46         6.8733e+02 9.6888e+01
 +   108   N46         7.7989e+02 1.2866e+02
 +   109   N7plus      1.3746e+02 1.2931e+01
 +   110   N7plus      1.0957e+02 9.6420e+00
 +   111   N7plus      1.4143e+02 8.1178e+00
 +   112   N7plus      1.7438e+02 8.5379e+00
 +   113   N7plus      1.2266e+02 6.6942e+00
 +   114   N7plus      6.9502e+01 4.0555e+00
 +   115   N7plus      4.0419e+01 3.6522e+00
 +   116   N7plus      5.1703e+01 1.2142e+01
 +
 +</file> 
 +
 +<file txt cod.rep>
 +576.804 648.115 415.967 134.959 49.8038 17.0007 13.4966 10.8941 36.2665 10
 + 331.468 437.656 451.776 240.534 57.7067 13.2768 5.35808 5.62816 5.54335 22.0554
 + 264.695 250.641 303.196 258.207 109.015 19.701 4.5608 1.79897 2.99548 3.35326
 + 508.821 197.266 170.266 170.747 121.025 41.7689 7.02678 1.94763 0.66689 1.94432
 + 608.97 380.651 123.387 77.2309 67.3283 42.4074 10.2661 1.8233 0.611378 0.225546
 + 406.822 442.883 223.925 57.1097 28.1946 25.1842 12.3202 2.82662 0.6587 0.318015
 + 560.339 306.459 280.249 100.62 19.9312 9.5291 7.16274 2.68007 0.759487 0.355867
 + 329.392 426.425 209.794 143.671 40.9893 5.57188 2.18885 1.82327 0.792831 0.336517
 +</file>
 +
 +
 +==== Spawning stock biomass ====
 +
 +Using these estimates, along with weight and maturity proportion data from ICES reports, we can make similar curves for the spawning stock biomass:
 +
 +{{:admb_real:all_cohorts:ssb_vs_vpa_1994_2001.png?180|}}
 +
 +Here the spawning stock biomass is a weghted sum including age groups 3-12 (13 for the VPA estimate), where the weights are the weight at age, and proportion maturity at age.
admb_real/all_cohorts/preliminary_experiments.1289915446.txt.gz · Last modified: 2010/11/16 13:50 by lennartfr